Les bases de la génétique

La souris à l’état sauvage est une souris de couleur agouti à poils lisses et unis. Lors de sa domestication, différentes mutations sont apparues. Certaines sont apparues spontanément, d’autres ont été travaillées en laboratoire et reproduites sur les souris de compagnie. Ce sont les raisons pour lesquelles, il existe à l’heure actuelle une grande variété de couleurs, de marquages et de poils chez la souris domestique.
Ces couleurs sont le fait d’apparitions de nouvelles mutations de gènes dans l’ADN de la souris, une souris possède deux versions différentes du même gène que l’on appelle allèle.
Après avoir découvert ces différentes mutations, l’homme a étudié leur fonctionnement et les a modélisé.
Chaque couleur, marquage et type de poils a été identifié par un code et par un nom. Une lettre représente un allèle et deux allèles sont séparés par un « / ».
liste des codes et des noms de variétés les plus courants chez la souris :
A/* : l’agouti (la couleur des souris sauvages)
a/a : le noir
a/a b/b : le chocolat (c’est la combinaison du chocolat et du noir)
A/* b/b : le cannelle ou le chocolat agouti
Arrêtons nous plus en détails sur ces codes :
Certaines lettres ne donnent pas la même couleur qu’elles soient écrites
en majuscules ou en minuscules. Les lettres majuscules comme le « A » sont des allèles dits dominants, les lettres en minuscules comme le « a » sont dits non-dominants ou
récessives, c’est-à-dire que si la souris porte pour le même gène
l’allèle « A » de l’agouti et l’allèle « a » du noir (que l’on notera
alors A/a) la souris sera agouti car l’agouti est dominant sur le noir
du fait que son code est une lettre majuscule. Les lettres récessives ne
s’expriment uniquement que si elles sont présentes par deux (comme a/a
pour le noir).
C’est la raison pour laquelle, on trouve souvent écrit A/* : Si une
souris est agouti, il est presque impossible de savoir si elle est A/A
ou A/a si on ne connait pas sa généalogie puisque la souris sera dans
les deux cas agouti. La plupart des allèles modifiant la couleur d’une
souris sont récessives. La majorité des allèles notés en majuscules
n’ont pas d’effet sur l’aspect de la souris.
Il existe une grande variété de gènes, pour chaque gène, la souris en
possèdent deux versions appelé Allèle. Les allèles sont logés à un
endroit appelé un locus. Par exemple, toutes les sortes de lettre A (A, Ay, a..) sont logées sur le même locus que l’on note simplement A.
Il en existe beaucoup, comme le locus A, B, C, D… S, W… Certains locus
logent des allèles modifiant la couleur (comme le locus A), d’autre
modifiant le marquage (comme le locus S) ou encore modifiant le poil
(comme le locus Sa).
Le génotype d’une souris est l’écriture de tous les allèles pris locus par locus. Cependant par souci de place, on écrit dans le code uniquement les locus où sont présent un allèle modifiant l’aspect de la souris. Il n’y a pas vraiment d’ordre imposé, mais il est usuel de les ranger simplement par ordre alphabétique.
Une souris chocolat dont le code est a/a b/b possède donc logés sur le locus A, deux allèles non dominants (ou récessives) du noir noté « a » et elle possède sur le locus B, deux allèles non dominants du chocolat noté « b » : La souris exprime donc le noir et le chocolat mais leur combinaison est appelé chocolat. De même une souris chocolat agouti noté A/* b/b est la combinaison de l’agouti et du chocolat.
Connaître le génotype (le code) de la souris permet de prédire la couleur des petits de cette souris. C’est une information importante à savoir, en effet, certaines combinaisons de gènes ne sont pas viables pour les petits qui en meurent soit très tôt dans l’utérus de la maman soit plus tard après la naissance. Les codes non viables ne sont pas très répandus mais existent. Notons la combinaison de deux souris red (Ay) et de deux souris variegated (W) où 25% des petits mourront.
Comment donc prédire la couleur des petits ?
Le mieux est de prendre un cas très simple puisque tous les calculs fonctionnent sous le même principe : Une souris noire femelle et une souris agouti mâle font une portée, le code de la souris noir est a/a, le code de la souris agouti est A/a (il est normalement pas possible de savoir si la souris est A/a ou A/A sans connaitre ses parents, nous supposerons que nous les connaissons).
Pour cela, il est simple d’utiliser des tableaux, il faut faire un tableau par locus (un pour le locus A, un pour le locus B..). En pratique, on ne fait un tableau que lorsqu’un des parents porte un allèle sur le locus susceptible de changer l’aspect de la souris.
Il faut faire un petit tableau pour le locus A :
• 1ére étape : on place les codes du locus A des parents
• 2éme tape : on place dans la première case vide en haut à gauche la première lettre du code de la maman et la première lettre du code du papa (que l’on sépare par un « / »):
• 3éme étape : on remplie les autres cases de la même manière en utilisant une lettre du papa et une lettre de la maman (celle sur la même ligne ou sur la même colonne) :
Ce type de tableau doit être fait pour chaque locus où la souris porte un allèle susceptible de modifier son aspect. Une fois les résultats obtenus pour chaque tableau, il faut les combiner entre eux. Cela devient vite assez complexes à partir du moment où il y a plus de deux tableaux. Il existe des logiciels sur internet pour faire ce travail (mousery database)
Rappel
lettre majuscule : dominant
Lettre miniscule : non-dominant
* = allèle inconnu
A- = A/A
Génotype : Ensemble des gènes que la souris transporte
Locus : Endroit où se situe le gène sur le chromosome
/ = sépare deux allèles basées sur un même locus
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